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Le regroupement du genre Homo avec les genres éteints Ardipithèque, Australopithèque, Paranthrope, et quelques autres, forme la sous-tribu des Hominines (Hominina).

Phylogénie des genres actuels d'hominidés, d'après Shoshani Chronologiquement, la séparation des différents genres d'Hominoïdes (Grands Singes), dont le genre Homo, s'est faite par des successions d'embranchements binaires (bifurcations), l'un des derniers en date ayant été la bifurcation entre Hominines et Panines il y a environ 7 millions d'années, ce qui explique que les Homo sapiens et les Chimpanzés partagent 98,8 % de leurs gènes en commun.

Plusieurs travaux indiquent que cette séparation ne semble pas avoir été brutale mais progressive.

Même si les études menées dans le cadre du paradigme Evo-Devo avec les gènes homéotiques (gènes architectes nécessaires à l'embryogenèse) montrent que certaines modalités évolutives ont été saltationnistes, la comparaison des chromosomes X de l'Homo sapiens et du Chimpanzé montre des similitudes qui semblent refléter une longue ré-hybridation entre leurs ancêtres respectifs.

Il est cependant trop fragmentaire pour avoir pu recevoir une dénomination.